«Даже у человека который
наставил на тебя автомат,
можно этот автомат выкупить»
Начало S.T.A.L.K.E.R. Чистое небо начинается с того что группа учёных вместе с наёмником по прозвищу Шрам попадает под выброс Зоны. Шрам странным образом выживает в этом выбросе и его находит загадочная группировка «Чистое небо», которая занимается изучением Зоны и всеми явлениями, которые в ней происходят.
Шрам выясняет, что последний выброс изменил Зону. Раньше где были безопасные места и сталкеры могли ходить по этим местам стали опасными. Там где не было аномалий теперь они есть. А гиблые места, куда не совался даже самый отчаянный человек, стали наоборот безлопастными. Выброс также странно повлиял на людей в Зоне. Разные группировки разобщились и стали воевать за владения территорией.
Шрам, помогая бойцам группировки «Чистое небо» на форпосте снова попадает под неожиданный выброс и выживает. В ходе беседы с Лебедевым он выясняет, что постоянные выбросы возможно происходят из-за того что кто-то в Зоне пробрался в центр преодолев выжигатель мозгов. И поэтому Зона, пытаясь защитить себя, запускает частые выбросы.
У Шрама необычные способности, но с каждым выбросом у него сгорает нервная система, и если выбросы не остановить то Шрам умрёт. Поэтому Лебедев хочет, чтобы он выяснил кто мог пробраться в центр Зоны и отправился туда за ним.
Наш сталкер Шрам отправляется на помощь группировке Чистое небо, чтобы усилилить её влияние на территории и помочь против другой группировки «Ренегаты»
Кордон. группировка «Вольные сталкеры»
Сидорович ждёт заказа посылки от сталкеров, но у сталкеров произошла размолвка с военными, через которых должна была пройти посылка в руки Сидоровича. Где теперь посылка он не знает и хочет чтобы наш герой который работает на группировку Чистое небо выяснил где она пропала и у кого она в руках.
Шрам отправляется на встречу со сталкерами за насыпью. Пообщавшись с главным сталкеров, мы узнаем, что они держат у себя в заложниках. А размолвка у сталкеров с военными произошла из-за командира последних. Сталкеры раньше отправляли через военных грузы, но их командир обнаглел и начал информацию сливать бандитам. Вот сталкеры спороли горячку и захватили командира и держат его в плену.
Наш герой попытается выяснить у этого командира майора Халецкого, где находится кейс с хабаром Сидоровича. Но майор пошлёт его. Сталкер объясняет Шраму, что майор ничего не рассказывает, потому что уверен, что за ним придут его сослуживцы. И если убрать его сослуживцев тогда майор не будет уверен в помощи и всё расскажет им.
Шрам убивает подельников командира и тот рассказывает, где спрятал кейс с хабаром. После чего он возвращает этот кейс Сидоровичу, а тот взамен рассказывает, про то что редкие детали у него искал сталкер по прозвищу Клык. И что Клык отправился на свалку, искать недостающие детали. И нашего героя принимают в волные сталкеры.
Свалка. Группировка бандиты.
Шрам отправляется на свалку, чтобы выяснить. у диггеров про Клыка и что за детали он ищет и для чего. Свалка практически вся кишит бандитами и он по пути захватывает позиции, укрепляя положение вольнх сталкеров. Он находит мёртвых диггеров и выясняет, что Клык не нашёл у них все запчасти, а лишь только некоторые. Клык отказался платить пока они не не найдут ему все детали. Один из диггеров Васян отправляется вслед за Клыком чтобы попробовать у него взять у него хоть сколько-то денег за те детали которые они ему предоставили. Шрам отправляется вслед за ними.
Встретив Васяна который засел на камне отбиваясь от диких собак, он выясняет что сталкер Клык направляется в Тёмную долину.
Тёмная долина. Группировка «Свобода»
Шрам отправляется в Тёмную долину вслед за клыком, которую контролирует группировка «Свобода». Поговорив с членами этой группировки на блокпосту он выясняет. что на территории на бойцов постоянно кто-то нападает. И если и был, какой сталкер в их местах, то это можно узнать только на основной базе группировки «Свободы».
Встретившись с комендантом на базе группировки «Свобода», Шрам получает от него задание убить пси-собаку, которая мешает сталкерам и тогда он сведёт его с главным, и то возможно знает, где находится Клык. Шрам находит КПК, в котором выясняется, что на бойцов нападают не просто так. Оказывается, это сам комендант сливает информацию на группировки и на тех совершаются нападения. Главарь группировки Чехов обещает рассказать о Клыке, если мы найдём этого коменданта.
После того как комендант был взят Чехов рассказал Шраму о том что хакнул частоту Клыка и теперь может следить за ним. И пошёл Клык на свалку и теперь за ним можно следить по его частоте.
Чехов просит, чтобы Шрам помог найти место, откуда наемники, работавшие на коменданта, приходили в долину. Для это нужно захватить две антенны с помощью которых можно провести разведку ландшафта и найти точку входа. и вместе с отрядом «Свободы» мы захватим эти антенны и разрушим туннель.
Вернувшись на свалку Шрама, грабят и забирают все его деньги и вещи. Очнувшись, он находит КПК Клыка, и выяснят, что в центр Зоны действительно была группа сталкеров. Чтобы выяснить их планы Шрам отправляется на поиски тайника этих сталкеров.
Группировка «Долг». Территория НИИ Агропром.
Шрам направляется на другую территорию под контролем группировки «Долг». Чтобы найти тайник сталкеров ему надо спуститься в подземку «НИИ Агропром». Лидер группировки обещает помочь ему, если тот поможет затопить пещеры, откуда постоянно лезут мутанты.
Найдя тайник Клыка выясняется, что группа сталкеров во главе со Стрелком и правда была в центре Зоны и снова туда собирается. Чтобы выяснить как они это сделали, наш наёмник отправляется к профессору Сахарову за разъяснениями.
Завод Янтарь. База учёных.
Профессор Сахаров рассказал, что к нему приходил сталкер Стрелок и хотел получить только что новое разработанное, но не настроенное устройство от защиты пси-излучения. Стрелок взял одно такое устройство, чтобы проверить его в полевых условия и отправился на территорию завода. Больше профессор его не видел.
На территории завода постоянно происходят нерегулируемые всплески пси-излучения, поэтому отправляться туда опасно, можно в любой момент погибнуть. Также он рассказал о том, что группа сталкеров успела сообщить по рации, что нашла какую-то техническую документацию на территории завода, которая может объяснить причину и свойства пси-излучения. Но эту группу накрыл всплеск пси-излучения и они все погибли.
Рыжий лес
Шрам отправляется на поиски пропавшей группы сталкеров и технической документации. Вся группа оказалась погибшей. Сахаров после изучения этой документации выяснил, что можно избавиться от пси-излучения, если на заводе перезапустить охладительную установку. Наш герой вместе с группой вольных сталкеров отправляется на завод полных зомби. Перезапустив охладительную систему, профессор Сахаров сообщает, что он поймал сигнал Клыка и что тот отправляется в сторону Рыжего леса.
Догоняя Стрелка чтобы остановить его и не пускать в центр Зоны. Он попадает в засаду, а сам Стрелок отрывается от погони. Сталкер двинулся в сторону выжигателя, но туда нельзя пройти без прототипа учёных. Единственная возможность догнать Стрелка это пройти через Лиманск. В сторону города ведёт тоннель, он сразу за мостом. Опустить мост можно только с другой стороны, но ту сторону контролируют бандиты.
Найти способ, как пробраться в город может только Лесник. Он может найти безопасную тропу туда. Теперь Шраму надо найти лачугу Лесника. Шрам ловит сигнал SOS и, следуя ему, находит сталкеров у которых выясняет, что в глубине леса есть пространственная аномалия, которая ведёт к Леснику.
Найдя пространственную аномалию которая находится прямо над заброшенным танком, Шрам встречается с Лесником и тот рассказывает о том, что дорожку к Лиманску можно найти. Но прежде нужно найти группу сталкеров, которые, где-то застряли и от них постоянно идут радиосигнал с призывом о помощи. Толком никто не может расслышать о чём сталкеры пытаются сообщить так как сигнал очень слабый. Если освободить сталкеров, то они смогут напасть на бандитов с тыла, захвативших мост и освободить его.
Поднявшись на вышку Шрам слышит сигнал от сталкеров, в котором они сообщают что застряли в одном месте, куда не пойдёшь всё на одном месте пространство замкнулось.
Чтобы вызволить сталкеров которые зестряли, Лесник предложил использовать артефакт который он недавно нашёл и благодаря ему выбрался из точно такой же аномалии в которой сейчас сталкеры. Назвал он этот артефакт «Компас». Но у него этот артефакт отобрали бандиты.
После того как Шрам отбил артефакт, он отправился вместе с группировкой «Свобода» на захват военной базы, чтобы передать сталкерам в аномалии инструкции как выбраться из неё.
Лиманск.
Встретившись вместе с отрядом «Чистое небо», Шрам весте с ними и освободившимися сталкерами отбивает мост у бандитов. Шрам вместе с группой отправляется на разведку в город.
Концовка S.T.A.L.K.E.R. Чистое небо
Шрам вместе с группировкой «Чистое небо» пробирается через Лиманск и уничтожает защиту Стрелка от пси-излучения. После чего происходит выброс и далее показывают как много сталкеров лежат в помещениии без сознания и показывают Шрама и татуировку на руке S.T.A.L.K.E.R.
